Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41P48193 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Epb41P48193 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41P48193 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41P48193 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41P48193 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41P48193 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41P48193 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41P48193 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41P48193 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41P48193 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41P48193 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms