Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nkx1-2P42580 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Nkx1-2P42580 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Nkx1-2P42580 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nkx1-2P42580 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nkx1-2P42580 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nkx1-2P42580 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms