Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl28P41105 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl28P41105 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl28P41105 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl28P41105 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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