Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt4P40749 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syt4P40749 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syt4P40749 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt4P40749 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt4P40749 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt4P40749 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt4P40749 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt4P40749 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt4P40749 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt4P40749 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt4P40749 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt4P40749 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt4P40749 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syt4P40749 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms