Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp3P39876 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp3P39876 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Timp3P39876 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp3P39876 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp3P39876 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp3P39876 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Timp3P39876 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Timp3P39876 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp3P39876 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Timp3P39876 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Timp3P39876 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Timp3P39876 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Timp3P39876 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Timp3P39876 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Timp3P39876 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timp3P39876 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Timp3P39876 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Timp3P39876 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms