Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddit3P35639 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ddit3P35639 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ddit3P35639 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ddit3P35639 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddit3P35639 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddit3P35639 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddit3P35639 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms