Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnd1P30999 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ctnnd1P30999 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ctnnd1P30999 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctnnd1P30999 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctnnd1P30999 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctnnd1P30999 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms