Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp2P29594 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casp2P29594 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp2P29594 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casp2P29594 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp2P29594 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casp2P29594 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp2P29594 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Casp2P29594 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp2P29594 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Casp2P29594 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Casp2P29594 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Casp2P29594 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Casp2P29594 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Casp2P29594 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp2P29594 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casp2P29594 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casp2P29594 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms