Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Casp1P29452 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casp1P29452 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casp1P29452 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casp1P29452 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casp1P29452 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Casp1P29452 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casp1P29452 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Casp1P29452 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Casp1P29452 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Casp1P29452 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casp1P29452 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Casp1P29452 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Casp1P29452 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casp1P29452 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casp1P29452 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Casp1P29452 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Casp1P29452 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Casp1P29452 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms