Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dusp1P28563 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dusp1P28563 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dusp1P28563 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dusp1P28563 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms