Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gjc1P28229 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gjc1P28229 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gjc1P28229 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gjc1P28229 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gjc1P28229 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gjc1P28229 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms