Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb9P28076 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb9P28076 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb9P28076 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb9P28076 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms