Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lef1P27782 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lef1P27782 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lef1P27782 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lef1P27782 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lef1P27782 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lef1P27782 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lef1P27782 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lef1P27782 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lef1P27782 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms