Protein–RNA interactions for Protein: P26954

Csf2rb2, Interleukin-3 receptor class 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2rb2P26954 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csf2rb2P26954 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csf2rb2P26954 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2rb2P26954 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2rb2P26954 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2rb2P26954 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf2rb2P26954 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2rb2P26954 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms