Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ChgaP26339 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ChgaP26339 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ChgaP26339 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ChgaP26339 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ChgaP26339 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ChgaP26339 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ChgaP26339 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ChgaP26339 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ChgaP26339 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ChgaP26339 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ChgaP26339 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ChgaP26339 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ChgaP26339 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ChgaP26339 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms