Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdk11bP24788 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cdk11bP24788 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Cdk11bP24788 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk11bP24788 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Cdk11bP24788 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cdk11bP24788 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Cdk11bP24788 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Cdk11bP24788 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk11bP24788 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cdk11bP24788 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Cdk11bP24788 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cdk11bP24788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cdk11bP24788 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms