Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HdcP23738 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HdcP23738 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdcP23738 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdcP23738 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdcP23738 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HdcP23738 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HdcP23738 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HdcP23738 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HdcP23738 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdcP23738 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdcP23738 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdcP23738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HdcP23738 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdcP23738 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdcP23738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdcP23738 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HdcP23738 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HdcP23738 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdcP23738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdcP23738 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HdcP23738 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdcP23738 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HdcP23738 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HdcP23738 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HdcP23738 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdcP23738 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HdcP23738 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdcP23738 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdcP23738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HdcP23738 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HdcP23738 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HdcP23738 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HdcP23738 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HdcP23738 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HdcP23738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HdcP23738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HdcP23738 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HdcP23738 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HdcP23738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HdcP23738 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HdcP23738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HdcP23738 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HdcP23738 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HdcP23738 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HdcP23738 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HdcP23738 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HdcP23738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HdcP23738 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HdcP23738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HdcP23738 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HdcP23738 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HdcP23738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HdcP23738 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HdcP23738 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HdcP23738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HdcP23738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HdcP23738 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HdcP23738 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HdcP23738 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HdcP23738 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HdcP23738 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HdcP23738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HdcP23738 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HdcP23738 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HdcP23738 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HdcP23738 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HdcP23738 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HdcP23738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HdcP23738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HdcP23738 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HdcP23738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HdcP23738 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HdcP23738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HdcP23738 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HdcP23738 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HdcP23738 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HdcP23738 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HdcP23738 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HdcP23738 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HdcP23738 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HdcP23738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HdcP23738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms