Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VimP20152 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VimP20152 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VimP20152 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VimP20152 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VimP20152 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VimP20152 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VimP20152 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VimP20152 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VimP20152 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VimP20152 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VimP20152 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VimP20152 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VimP20152 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VimP20152 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VimP20152 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VimP20152 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VimP20152 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VimP20152 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VimP20152 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VimP20152 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VimP20152 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VimP20152 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VimP20152 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VimP20152 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VimP20152 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VimP20152 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VimP20152 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VimP20152 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VimP20152 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VimP20152 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VimP20152 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VimP20152 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VimP20152 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VimP20152 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VimP20152 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VimP20152 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VimP20152 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VimP20152 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VimP20152 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
VimP20152 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VimP20152 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VimP20152 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VimP20152 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VimP20152 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VimP20152 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VimP20152 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VimP20152 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VimP20152 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VimP20152 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VimP20152 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VimP20152 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VimP20152 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VimP20152 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VimP20152 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VimP20152 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VimP20152 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VimP20152 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VimP20152 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VimP20152 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VimP20152 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VimP20152 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VimP20152 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VimP20152 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VimP20152 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VimP20152 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VimP20152 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VimP20152 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VimP20152 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VimP20152 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VimP20152 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms