Protein–RNA interactions for Protein: P13595

Ncam1, Neural cell adhesion molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncam1P13595 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncam1P13595 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncam1P13595 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncam1P13595 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncam1P13595 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncam1P13595 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms