Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il1r1P13504 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Il1r1P13504 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Il1r1P13504 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Il1r1P13504 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Il1r1P13504 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Il1r1P13504 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Il1r1P13504 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Il1r1P13504 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Il1r1P13504 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Il1r1P13504 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Il1r1P13504 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Il1r1P13504 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Il1r1P13504 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Il1r1P13504 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms