Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa1P11477 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa1P11477 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa1P11477 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa1P11477 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Defa1P11477 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa1P11477 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms