Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Parp1P11103 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Parp1P11103 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Parp1P11103 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp1P11103 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Parp1P11103 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Parp1P11103 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Parp1P11103 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Parp1P11103 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Parp1P11103 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Parp1P11103 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Parp1P11103 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Parp1P11103 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Parp1P11103 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp1P11103 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Parp1P11103 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Parp1P11103 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Parp1P11103 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp1P11103 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Parp1P11103 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Parp1P11103 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms