Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem254aP0DN89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmem254aP0DN89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem254aP0DN89 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem254aP0DN89 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.5 ms