Protein–RNA interactions for Protein: P04345

Cryga, Gamma-crystallin A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygaP04345 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CrygaP04345 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CrygaP04345 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygaP04345 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygaP04345 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CrygaP04345 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygaP04345 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygaP04345 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrygaP04345 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrygaP04345 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrygaP04345 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrygaP04345 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CrygaP04345 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygaP04345 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygaP04345 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CrygaP04345 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms