Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Lamc1P02468 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Lamc1P02468 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lamc1P02468 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lamc1P02468 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lamc1P02468 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lamc1P02468 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lamc1P02468 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lamc1P02468 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms