Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01669 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P01669 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01669 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01669 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01669 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01669 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01669 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01669 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01669 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01669 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01669 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01669 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01669 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01669 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01669 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01669 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01669 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01669 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01669 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01669 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01669 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P01669 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01669 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01669 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01669 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01669 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P01669 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01669 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01669 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01669 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01669 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01669 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01669 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01669 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01669 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01669 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P01669 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01669 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01669 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01669 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01669 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01669 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01669 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01669 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01669 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01669 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01669 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01669 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01669 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01669 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01669 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01669 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
P01669 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01669 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01669 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01669 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01669 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01669 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01669 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01669 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01669 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01669 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01669 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01669 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01669 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01669 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01669 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01669 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01669 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01669 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01669 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01669 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01669 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01669 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01669 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms