Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01659 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01659 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01659 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01659 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01659 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01659 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01659 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01659 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01659 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01659 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01659 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01659 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01659 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01659 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01659 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01659 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01659 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01659 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01659 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01659 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01659 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01659 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01659 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01659 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01659 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01659 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01659 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01659 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01659 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01659 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01659 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01659 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01659 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01659 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01659 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01659 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01659 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01659 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01659 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01659 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01659 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01659 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01659 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01659 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01659 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01659 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01659 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01659 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01659 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01659 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01659 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01659 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01659 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01659 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01659 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01659 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01659 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01659 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P01659 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01659 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01659 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01659 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01659 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01659 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms