Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igk-V19-17P01633 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igk-V19-17P01633 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igk-V19-17P01633 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igk-V19-17P01633 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igk-V19-17P01633 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms