Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CcnkO88874 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CcnkO88874 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CcnkO88874 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CcnkO88874 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CcnkO88874 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CcnkO88874 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CcnkO88874 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CcnkO88874 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcnkO88874 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CcnkO88874 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CcnkO88874 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms