Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
JtbO88824 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JtbO88824 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JtbO88824 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JtbO88824 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
JtbO88824 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JtbO88824 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JtbO88824 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JtbO88824 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JtbO88824 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
JtbO88824 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JtbO88824 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JtbO88824 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
JtbO88824 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JtbO88824 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JtbO88824 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JtbO88824 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
JtbO88824 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
JtbO88824 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
JtbO88824 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
JtbO88824 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JtbO88824 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
JtbO88824 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
JtbO88824 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JtbO88824 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
JtbO88824 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JtbO88824 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
JtbO88824 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JtbO88824 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
JtbO88824 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
JtbO88824 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
JtbO88824 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
JtbO88824 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
JtbO88824 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
JtbO88824 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JtbO88824 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JtbO88824 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JtbO88824 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
JtbO88824 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
JtbO88824 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JtbO88824 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JtbO88824 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
JtbO88824 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
JtbO88824 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
JtbO88824 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
JtbO88824 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JtbO88824 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
JtbO88824 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JtbO88824 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
JtbO88824 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JtbO88824 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JtbO88824 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JtbO88824 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JtbO88824 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
JtbO88824 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JtbO88824 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
JtbO88824 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
JtbO88824 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JtbO88824 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
JtbO88824 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
JtbO88824 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
JtbO88824 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms