Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClppO88696 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClppO88696 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClppO88696 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClppO88696 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ClppO88696 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClppO88696 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClppO88696 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClppO88696 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClppO88696 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClppO88696 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClppO88696 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClppO88696 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ClppO88696 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClppO88696 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClppO88696 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClppO88696 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClppO88696 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ClppO88696 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClppO88696 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClppO88696 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClppO88696 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClppO88696 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClppO88696 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClppO88696 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClppO88696 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClppO88696 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClppO88696 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ClppO88696 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ClppO88696 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClppO88696 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClppO88696 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ClppO88696 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClppO88696 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClppO88696 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClppO88696 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClppO88696 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClppO88696 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ClppO88696 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClppO88696 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClppO88696 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClppO88696 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClppO88696 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClppO88696 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ClppO88696 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClppO88696 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClppO88696 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClppO88696 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ClppO88696 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClppO88696 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ClppO88696 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClppO88696 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClppO88696 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClppO88696 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClppO88696 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClppO88696 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClppO88696 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ClppO88696 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClppO88696 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClppO88696 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClppO88696 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ClppO88696 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClppO88696 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClppO88696 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ClppO88696 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClppO88696 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClppO88696 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ClppO88696 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClppO88696 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClppO88696 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClppO88696 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClppO88696 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClppO88696 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ClppO88696 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClppO88696 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClppO88696 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ClppO88696 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClppO88696 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClppO88696 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClppO88696 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ClppO88696 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClppO88696 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ClppO88696 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClppO88696 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms