Protein–RNA interactions for Protein: O88338

Cdh16, Cadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh16O88338 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdh16O88338 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh16O88338 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh16O88338 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdh16O88338 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh16O88338 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms