Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad51dO55230 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad51dO55230 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad51dO55230 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad51dO55230 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad51dO55230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad51dO55230 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms