Protein–RNA interactions for Protein: O55192

Slc6a2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a2O55192 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc6a2O55192 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc6a2O55192 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc6a2O55192 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a2O55192 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a2O55192 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a2O55192 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a2O55192 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms