Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2a2O55143 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2a2O55143 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp2a2O55143 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2a2O55143 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2a2O55143 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2a2O55143 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms