Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdkO55028 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdkO55028 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BckdkO55028 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdkO55028 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BckdkO55028 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BckdkO55028 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BckdkO55028 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BckdkO55028 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdkO55028 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdkO55028 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BckdkO55028 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdkO55028 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdkO55028 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BckdkO55028 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdkO55028 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BckdkO55028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 312.4 ms