Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NlkO54949 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NlkO54949 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NlkO54949 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NlkO54949 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NlkO54949 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NlkO54949 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NlkO54949 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NlkO54949 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NlkO54949 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NlkO54949 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NlkO54949 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NlkO54949 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NlkO54949 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NlkO54949 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NlkO54949 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NlkO54949 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NlkO54949 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NlkO54949 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NlkO54949 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NlkO54949 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NlkO54949 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NlkO54949 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NlkO54949 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NlkO54949 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NlkO54949 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NlkO54949 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NlkO54949 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NlkO54949 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NlkO54949 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NlkO54949 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NlkO54949 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NlkO54949 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NlkO54949 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NlkO54949 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NlkO54949 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NlkO54949 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NlkO54949 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NlkO54949 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NlkO54949 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NlkO54949 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NlkO54949 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NlkO54949 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NlkO54949 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NlkO54949 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NlkO54949 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NlkO54949 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NlkO54949 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NlkO54949 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NlkO54949 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NlkO54949 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NlkO54949 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NlkO54949 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NlkO54949 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NlkO54949 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NlkO54949 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NlkO54949 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NlkO54949 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NlkO54949 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NlkO54949 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NlkO54949 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NlkO54949 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms