Protein–RNA interactions for Protein: O54709

Klrk1, NKG2-D type II integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrk1O54709 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Klrk1O54709 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Klrk1O54709 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Klrk1O54709 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Klrk1O54709 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Klrk1O54709 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Klrk1O54709 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Klrk1O54709 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms