Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sdc4O35988 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sdc4O35988 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sdc4O35988 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sdc4O35988 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Sdc4O35988 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sdc4O35988 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sdc4O35988 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms