Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk5r2O35926 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk5r2O35926 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk5r2O35926 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5r2O35926 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdk5r2O35926 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdk5r2O35926 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms