Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chil3O35744 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chil3O35744 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chil3O35744 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chil3O35744 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chil3O35744 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chil3O35744 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chil3O35744 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chil3O35744 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chil3O35744 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chil3O35744 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms