Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KeraO35367 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KeraO35367 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KeraO35367 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KeraO35367 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KeraO35367 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KeraO35367 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KeraO35367 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KeraO35367 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KeraO35367 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KeraO35367 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KeraO35367 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KeraO35367 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KeraO35367 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KeraO35367 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KeraO35367 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KeraO35367 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KeraO35367 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KeraO35367 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KeraO35367 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KeraO35367 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KeraO35367 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KeraO35367 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KeraO35367 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KeraO35367 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KeraO35367 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KeraO35367 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KeraO35367 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KeraO35367 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KeraO35367 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KeraO35367 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KeraO35367 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KeraO35367 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KeraO35367 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KeraO35367 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KeraO35367 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KeraO35367 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KeraO35367 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KeraO35367 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KeraO35367 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KeraO35367 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KeraO35367 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KeraO35367 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KeraO35367 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KeraO35367 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KeraO35367 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KeraO35367 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KeraO35367 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KeraO35367 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KeraO35367 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KeraO35367 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KeraO35367 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KeraO35367 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KeraO35367 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KeraO35367 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KeraO35367 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KeraO35367 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KeraO35367 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KeraO35367 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KeraO35367 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KeraO35367 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KeraO35367 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KeraO35367 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KeraO35367 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KeraO35367 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KeraO35367 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KeraO35367 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KeraO35367 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KeraO35367 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KeraO35367 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms