Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cpsf2O35218 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpsf2O35218 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpsf2O35218 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpsf2O35218 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpsf2O35218 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms