Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bhlhe40O35185 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bhlhe40O35185 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bhlhe40O35185 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bhlhe40O35185 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bhlhe40O35185 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bhlhe40O35185 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bhlhe40O35185 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms