Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q1O19441 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-Q1O19441 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q1O19441 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q1O19441 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q1O19441 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2-Q1O19441 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms