Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E2

Gm8271, Predicted gene 8271, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8271L7N2E2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gm8271L7N2E2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Gm8271L7N2E2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gm8271L7N2E2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gm8271L7N2E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm8271L7N2E2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm8271L7N2E2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm8271L7N2E2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Gm8271L7N2E2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Gm8271L7N2E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms