Protein–RNA interactions for Protein: L7N200

Gm5152, Predicted gene 5152 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5152L7N200 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5152L7N200 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5152L7N200 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5152L7N200 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5152L7N200 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5152L7N200 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm5152L7N200 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5152L7N200 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5152L7N200 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm5152L7N200 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms