Protein–RNA interactions for Protein: G3XA57

Rab11fip2, Rab11 family-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip2G3XA57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab11fip2G3XA57 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab11fip2G3XA57 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11fip2G3XA57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rab11fip2G3XA57 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rab11fip2G3XA57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rab11fip2G3XA57 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip2G3XA57 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms