Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nccrp1G3X9C2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nccrp1G3X9C2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nccrp1G3X9C2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nccrp1G3X9C2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nccrp1G3X9C2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nccrp1G3X9C2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms