Protein–RNA interactions for Protein: G3UW81

Cyp4f40, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f40G3UW81 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f40G3UW81 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cyp4f40G3UW81 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyp4f40G3UW81 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp4f40G3UW81 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp4f40G3UW81 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp4f40G3UW81 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms